中科院昆明動物研究所張云研究員課題組與深圳華大基因研究院合作,解析了新型實驗動物中國樹鼩的全基因組,系統評估了樹鼩作為藥物研發實驗動物的特征和優勢。研究近日發表于《公共科學圖書館·綜合》。
研究不僅為中國樹鼩用于新藥研發的藥效學、藥理學和毒理學評價提供了系統的基礎信息數據和科學依據,而且揭示了特定藥物研發中使用樹鼩作為實驗動物的獨特優勢。
據介紹,目前藥物研發中廣泛使用的大鼠、小鼠等嚙齒類動物與人種屬差異較大,獲得的研究結果經常與人相距甚遠,造成藥物研發在大量投入后失敗。樹鼩是靈長類動物近親,作為實驗動物具有個體小、繁殖快、易于飼養等有利特點。
科研人員首先開發了一種可用于藥物靶標預測和基于模型藥靶評價的有效方法,進一步在基因組和轉錄組層面上對中國樹鼩進行了系統全面的藥物靶標預測和分析。
在獲得的3482種中國樹鼩藥物靶標蛋白質中,排名最高的446種蛋白質和總得分最高的1049種蛋白質包含了許多與腫瘤治療、抑郁癥、衰老及機能減退、心血管疾病和代謝性疾病藥物靶標相關的人類同源分子。與目前廣泛使用的小鼠藥物靶蛋白相比,50%以上的中國樹鼩藥物靶蛋白與人類藥物靶蛋白的相似性更高。
同時,藥物靶標確認實驗證實了與心血管疾病藥物研發密切相關的蛋白酶激活受體在樹鼩血小板上的表達模式與人類血小板一致。
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