中國首部二代基因測序技術臨床應用共識出臺

　　當今，腫瘤診治已邁入個體化及精準醫學的時代，從“一刀切”向“針對每一個病人的具體病情，正確選擇并精確地應用適當的治療方法”發展，這對進一步提高治療的有效性，降低不必要的藥物副作用和節約醫療支出都有著深遠的意義。腫瘤的精準醫療是一項系統工程，包括精準診斷、精準治療、精準管理多個環節，均以精準的腫瘤基因檢測為基礎。生物技術的進步使得探索具有臨床意義的基因異常變得可能等。

　　據報道，目前我國正在制定“精準醫療”戰略規劃，這一規劃或將被納入到“十三五”重大科技專項，這預示著在中國，精準醫學正駛入高速發展的快車道。在精準醫學時代的早期階段，規范滿足臨床診療要求的二代基因測序技術（NGS）的標準與應用，提高準入門檻，確保這部行業發展“導航儀”的精準性顯得尤為重要。基于此，中國臨床腫瘤學會（CSCO）肺癌診療指南發布會在北京舉行，同時出臺首部《中國腫瘤驅動基因分析聯盟（CAGC）二代測序技術臨床應用共識》（下稱《共識》），幫助指導基因檢測及NGS技術規范合理應用，給我國患者切實帶來治療和生存獲益。

　　“臨床腫瘤學實踐中，基因檢測已成為精準診治的前提和核心之一。《共識》的出臺，將為廣大臨床醫生提供公認規范指導，提高腫瘤診治的檢測質量和結果準確性”，CSCO理事長吳一龍教授表示：“隨著高通量的大規模平行測序技術的發展， NGS在開展靶向精準診治實踐與試驗研究中有著廣闊前景，能更好的幫助臨床醫生在實際臨床患者診療中，提升診斷水平，做出合理正確決策，提高患者生存質量。”

　　“共識”由實驗室癌癥遺傳學家、臨床腫瘤學專家、生物信息學專家、病理學家和其他人員組成的專家組起草，包含了NGS的技術應用現狀、臨床多個瘤種的NGS檢測內容、樣本處理、測序流程、數據管理、信息學分析、結果報告解釋和咨詢等多個方面內容的闡述。CSCO計劃通過在基因檢測方面進行三個步驟全面提升精準醫學：形成和發布NGS臨床應用共識是第一步的工作，然后是通過一系列標本檢測驗證共識是否可行、準確，并做相應的修正。第三步是和藥物研發公司聯合檢測，通過大數據分析發現其中某個特別的基因，或完全有可能作為藥物治療的靶點，幫助藥物研發公司對此靶點開展研究，這對推動整個行業的發展作用非常重大。

　　在此基礎上，CSCO還計劃針對肺癌、乳腺癌、肝癌、胃癌、結直腸癌、包括白血病在內的造血系統等六種惡性實體瘤開展以NGS 技術為主的驅動基因譜分析，提出適合我國臨床腫瘤學實踐的一系列腫瘤的 NGS檢測技術、分析內容、診治模式的共識、流程、標準和規范。

　　中國腫瘤驅動基因分析聯盟（CAGC）秘書長、廣東省人民醫院廣東省肺癌研究所副所長張緒超教授指出：“準確是NGS體現臨床價值的前提。我國之前一直未形成NGS的相關規范。事實上，臨床上對NGS的實際需求非常大，僅僅肺癌一年就有超過65萬的新發病例。通過‘共識’規范從樣本的取得到報告的給出每個環節，高標準、嚴管理，確保結果準確，應用于患者全程病程管理當中。”

　　這與燃石醫學始終致力于用國際前沿生物技術、基因組大數據分析能力為腫瘤患者進行個性化治療提供更好的指導的愿景不謀而合。燃石醫學創始人兼CEO漢雨生表示：“我們很高興看到‘共識’的出臺，隨著行業規范化的深入，一些優秀的企業和產品將在大浪淘沙中沉淀下來。作為第一家將NGS腫瘤臨床化產品推向市場的公司，我們一直在努力推動基因組技術的臨床應用。我們與在測序和芯片技術上全球領先的Illumina公司開展合作，促進更多高品質分子診斷解決方案應用于腫瘤臨床領域，使更多患者從中獲益。在過去兩年中，我們已經與國內110家三甲醫院進行合作。我們與全國頂尖的肺癌專家合作，已經產生了大量的臨床研究成果及數據，這些成果將為未來腫瘤的精準醫療提供堅實的基礎。同時我們與政府相關部門一起推進NGS在腫瘤領域的標準化、普及化。”

　　據漢雨生透露，2016年燃石醫學還將獲得幾個含金量高的資質證書，而這些證書會有利于燃石醫學業務的進一步發展。

　　現場采訪實錄（一）：

　　主題：肺癌臨床治療前沿趨勢與基因檢測的可行性

　　受訪人：中國臨床腫瘤學會（CSCO）理事長吳一龍教授

　　精準醫學是利用現有技術來檢測人類基因，通過基因改變情況使治療更精準、有效和安全。而這一切的前提是必須利用現有的基因學知識，通過測序方法獲取基因學知識。

　　早在2004年精準醫學工作就已開始，但當時并未形成產業，中國NGS之所以大熱，一夜間千樹萬樹梨花開，這要追溯到去年初美國奧巴馬在國情咨文中提出“精準醫學。這股風吹到中國以后，國家科技部、國家衛計委等部門開始重視起來，不斷學習、研究精準醫學，與此同時，很多市場嗅覺敏感的企業也已有所行動。

　　美國精準醫學的發展路徑是先制定標準規范，再開始實踐，而我國是測序工作先進行，伴隨著各類宣傳工作，隨后在實踐中認識到需要有標準、規范來定義如何去做，應遵循怎樣的標準，避免爭執。

　　2015年9月，我們首先成立中國腫瘤驅動基因分析聯盟（CAGC），CAGC把制定共識這項工作納入了聯盟起始的第一步。經過幾個月的調研，并參照國際上的標準，2016年3月舉辦了第一次研討會，邀請了臨床腫瘤學、病理學、分子生物學、基因測序專家以及有影響力的檢測企業的技術官一起討制定共識的必要性、可行性，并著手起草共識。經過多次反復討論，共識出爐。

　　問：您剛才提及，研討會上臨床腫瘤學、病理學、分子生物學專家一起討論了NGS領域亟待解決的問題，具體指的是哪些問題？

　　吳一龍：其中牽涉到了很多問題。首先，基因測序的提取組織究竟是腫瘤組織，還是正常組織？共識明確：組織提取物必須由病理學專家確認是腫瘤組織時才能進行測序。其次，這些送檢腫瘤組織中，如何提取出用來做分析的成分？組織提取后送去檢測，檢測技術是怎樣的？其中很復雜，如檢測多少個基因，測序深度多少層，此時必須要達成共識。最后，檢測報告應該怎樣撰寫、如何發放？不是所有醫生都能看得懂檢測報告，很多醫生要從頭學。

　　問：在臨床應用上，在眾多的NGS技術平臺中進行選擇時，應重點注意哪些方面？

　　吳一龍：我們今年的共識主要是在技術方面進行了規定作為第一步，如果要檢測單個基因是否發生了變異，目前用二代基因測序技術就是“殺雞用牛刀”。現在針對單個基因檢測，我們有很多更便宜的方法來用，國家已經批準了很多。但是，假如想同時檢測多個基因，推薦使用NGS。

　　在討論共識的過程中，CSCO要求很多NGS檢測公司提供檢測數據，供CSCO測算和測評。包括燃石醫學就提供了相關數據，這些公司對自己的產品是比較自信的，也經得起推敲；也有公司不敢提供，那就要打個問號了。其實，可以從各個方面對此進行監督。

　　問：二代基因測序技術規范發展起來之后，對后續藥物研發和選擇有什么幫助？

　　吳一龍：幫助會非常大，這也是CSCO/CAGC接下來相關工作的第二步和第三步。CSCO計劃通過在基因檢測方面進行三個步驟全面提升精準醫學：形成和發布NGS臨床應用共識是第一步的工作，然后是通過一系列標本檢測驗證共識是否可行、準確，并做相應的修正。第三步是和藥物研發公司聯合檢測，通過大數據分析發現其中某個特別的基因，或完全有可能作為藥物治療的靶點，幫助藥物研發公司對此靶點開展研究，這對推動整個行業的發展作用非常重大。

　　現場采訪實錄（二）：

　　主題：肺癌臨床治療前沿趨勢與基因檢測的可行性

　　受訪人：中國腫瘤驅動基因分析聯盟秘書長、廣東省人民醫院廣東省肺癌研究所副所長張緒超教授

　　問：我國NGS發展存在哪些不規范現象？《共識》的出臺對NGS規范有什么好處？

　　張緒超教授：我國之前一直未形成NGS的相關規范。但我國現實臨床對NGS的需求非常大，僅肺癌一年就有超過65萬新發病例。理論上來講，分子診斷應該應用于患者全程病程管理當中。此外，NGS是由多個檢測技術組成的系統工具，只有每個環節進行質量控制，才能保證臨床使用數據是有效的，臨床學家才能提出準確的治療方案，讓患者真獲益。基于此， CSCO出臺《共識》，規定每個特定的NGS測試項目都需要經過嚴格的技術驗證合格后才可以用于臨床腫瘤檢測，并強烈建議各實驗室參加衛計委組織的“NGS相關的室間質量評估項目”來提高檢測能力和質量*。NGS檢測規范具有現實意義，對檢測方、患者都有好處。

　　*注：（燃石醫學在1月和4月兩次通過衛生部臨床檢驗中心開展的《全國腫瘤診斷與治療高通量測序檢測室間質量評價》，兩次測評的結果均為優秀）。

　　問：目前，對于預防性檢測領域，即癌癥早期篩查診斷檢測，NGS有何幫助？

　　張緒超教授：從靶向治療角度來看，我們還沒有辦法將靶向治療推向早期篩查診斷，缺乏相關臨床數據。但是，NGS用于早期疾病診斷對患者有一定幫助。早期進行分子分型診斷，幫助患者后續全程管理，可以及早發現患者的基因亞型，對于后續疾病復發、耐藥等策略制訂都有很大的幫助。當然，需要強調的是不能在早期檢測后馬上就能用靶向藥物。對于NGS的應用一定要明確其應用目的。

　　問：《共識》從各個環節是怎么規范NGS的？

　　張緒超教授：在NGS的檢測中每個環節都很重要。樣本采集、處理也非常重要，這也是《共識》將NGS應用中的樣本處理作為一個單獨內容進行詳細解說的原因。舉個例子，一個沒有做詳細質控評估的樣本，如果腫瘤細胞含量只有1%甚至沒有，檢測結果就不能真正反映腫瘤的分子特征和生物技術特征。因此，我們要求做樣本規范，在NGS技術條件下，至少有20%的細胞是腫瘤細胞才有可能探測到臨床所需的靶點是否正確。

　　當然樣本評估不僅包括腫瘤細胞含量的多少，還包括不同樣本類型應該如何處理等。比如，對于新鮮標本需要做冰凍評估；而對已經做好石蠟包埋標本，需要進一步進行形態學評估。對于不同樣本類型，《共識》做了詳細界定，這是其中一個重要的內容，也是NGS檢測非常重要的環節。

　　問：目前，對于臨床上已確認的可控基因有多少？

　　張緒超教授：根據瘤種不同，基因也不同。過去十年肺癌發展非常快，2004年發現了有藥、靶點以及檢測技術的第一個可控基因EGFR。目前，肺癌里面有EGFR、ALK等8個基因必須檢測。相信未來還將有更多的基因發現，基因數量會明顯上升，如果考慮其他瘤種，基因數量會更多。

　　*注：燃石醫學是唯一一個開發了NGS臨床應用共識所要求的肺癌8基因檢測產品的公司，并且從臨床應用的便利性上開發了組織檢測和無創血液ctDNA檢測的兩種產品。

　　問： NGS需求在臨床應用方面需要符合什么樣的質量？

　　張緒超教授：《共識》規定了NGS在臨床腫瘤診斷中的質量需求，規定每個特定測試項目都要經過嚴格的技術驗證，合格后才可以用于臨床腫瘤檢測，所有 CAGC項目都要滿足共識中的NGS評價體系。一個好的NGS分析技術能否真正應用到臨床，必須滿足三個條件：分析技術滿足要求*，臨床檢測能力符合要求，臨床應用一定給患者帶來好處。再好的技術如果在臨床上對患者沒有用處，也是無用的。

　　*注：（臨床組織樣本的NGS“有效測序深度”應達到500X以上，燃石醫學達到1000X，血漿游離DNA標本的NGS“有效測序深度”應達到1000X以上，燃石醫學達到10000X）

　　問：《共識》出臺后，對二代基因測序的產業，包括二代測序公司會產生什么樣的影響？

　　張緒超教授：從我們角度來講，一定是推動而非阻礙，是正確推動方向的作用。

　　這次共識出臺，我們邀請了很多NGS公司的技術專家參與進來，他們會意識到只有NGS規范化，整個行業才能正常發展。患者檢測量大了，才有更好的發展，這是多方獲益的事情。

　　CAGC下一步的NGS可行性驗證和臨床試驗，會邀請一些好的技術公司參與，向他們傳遞正確的信息，這些公司也通過這種形式知道哪些是真正對患者帶來好處的。所有這些都忠于一個理念，就是患者利益高于一切，能夠讓患者生命延長，這是我們最關注的核心目標。

　　現場采訪實錄（三）：

　　主題：肺癌臨床治療前沿趨勢與基因檢測的可行性

　　受訪人：燃石醫學CEO、創始人漢雨生先生

　　燃石醫學成立于2014年，目前在產品研發、學術推廣以及市場教育方面在國內做得都非常領先，公司目前已獲得將近2億元投資。在北上廣建立了超過1萬平米實驗室和GMP生產車間，合作醫院有110多家。

　　和其他醫療子行業發展比較緩慢所不同，精準醫療行業在國家政策支持及引導下，以前所未有的速度高速發展。腫瘤精準醫療行業是新興的多學科（醫學、分子生物學、測序技術、生物信息學）交叉的行業。精準醫療檢測先行，精準診斷是精準醫療從發現、監控到治療等各個步驟中不可或缺的。基于此，燃石醫學在醫學、生物信息學各方面都匯集了超過200名業內頂尖人才，用強大的資金和人才發展這個行業。

　　問：燃石參與CSCO/CAGC首部NGS共識指定相關的工作中嗎？

　　漢雨生先生：是的。CSCO理事長吳一龍教授高屋建瓴地設計了此部《共識》，涉及醫務人員的想法，還涉及商業公司實際經驗和理念。吳教授細心傾聽了很多公司的意見，燃石也是其中主要公司成員，提供了自身經驗和知識積累。

　　吳教授推動的《共識》，對測序深度、分析流程，以及實驗規范性有了具體的技術標準。燃石醫學的除了產品達到世界領先的敏感性和特異性之外，公司還獲得很多重量級的認證——今年5月份燃石醫學將成為中國第一家拿到腫瘤NGS檢測CLIA核心認證的公司。CLIA認證不僅代表燃石的產品達到了國際的標準，而且代表燃石檢測的質量可靠性和穩定性達到國際的認可。

　　問：燃石成立迄今為止我們上市了哪些產品，包括儀器和設備嗎？

　　漢雨生先生：燃石醫學的上市產品涉及8個瘤種，21款產品，涉及到基于組織的重要檢測、基于血液的重要檢測，還包括監控產品。在建庫、捕獲、生物信息學分析層面等自主研發的部分，燃石醫學已申請13個ZL。

　　從產品的研發設計之初，我們就秉持燃石的產品一定要滿足臨床實際使用和患者最終獲益。因此，我們不做大一統的產品，而是根據臨床精準檢測和治療的需要，分不同的瘤種和臨床治療不同階段的需要，開發和推出不同的產品。比如：燃石是唯一一個開發臨床NGS臨床應用共識所強調的肺癌8個基因的檢測產品，我們不讓患者過度檢測。

　　問：國內NGS領域存在很多不規范現象，商業化趨勢非常明顯。燃石作為操作規范的公司，對NGS共識出臺幫助規范這個行業有怎樣的期待？

　　漢雨生先生：燃石一直大力支持CSCO/CAGC出臺NGS共識。現在國內有200多家NGS公司，有些很好的公司會在大浪淘沙后沉淀下來，但更多的公司其實是魚目混珠。在精準醫療的行業，最后只會剩下幾家經得起時間考驗和NGS共識考驗而發展起來的NGS公司。在早期行業混亂時，燃石愿意幫助協會或政府來做正本清源的事情，幫助確定怎樣的技術是市場上真正需要的、合格的。CSCO目前確立的標準，燃石醫學早已達標，但我們志存高遠，擁有遠高于行業要求的標準。

　　問：共識中是否有對基因測序第三方檢測企業的直接推廣和銷售的對象、形式進行了規定？那么，我們是不是更推薦由醫生建議適合的患者進行檢測？

　　漢雨生先生：從對患者負責的角度來講，患者、甚至是健康人直接從一個公司購買一款沒有經過認證或者沒有標準的產品是非常危險的事情。比如現在為數不少的二代測序公司連臨檢所的資質都沒有，就直接向患者出售，甚至有的越過醫生直接出售給患者群，這樣的做法非常危險。這也是吳一龍院長提及的有70%檢測數據匹配不上的重要原因。

　　問：燃石有參加衛計委組織的室間質評嗎？

　　漢雨生先生：我們每年都會參加，每次都以優秀的成績通過；之前是比較簡單的組織基因檢測，隨后還會參加更復雜的ctDNA評選。

　　EGFR的室間質評很早就有，而NGS室間質評去年才開始有。衛生部臨檢中心也看到NGS需要規范化，從臨檢中心的角度，第一點是做市場技術摸底，看看哪些公司合格/不合格，或哪些醫院合格/不合格。