1、留尿前清洗外陰，使用的容器應清潔無污染，不可混有洗滌劑、消毒劑和防腐劑等化學物質，以免影響檢查結果。
2、留尿后應該立刻送檢，避免尿液放置后導致檢測結果錯誤。
3、采用中段尿培養菌落計數為1000個以內(<1000/mL),多為體外感染。
4、若已使用抗菌素或利尿劑等，應及時向醫生反映。
5、采集尿標本應當嚴格無菌操作：
一般取中段尿。女性病人，應該先肥皂水清洗外陰部，再以無菌水洗，滅菌紗布擦干，讓患者排尿，棄去前段尿，將中段尿留取在無菌容器內，尿量約10mL.
男性病人應該先用肥皂水清洗尿道口，再用清水沖洗，包皮過長者需翻開包皮沖洗，然后采集中段尿。嬰兒許清潔消毒陰部，將無菌小瓶口對準尿道貼膠布固定，等待尿液標本后送檢。
6、細菌培養與藥敏試驗應該一起進行。