• <noscript id="0aaaa"></noscript>
  • <noscript id="0aaaa"><kbd id="0aaaa"></kbd></noscript>
    <table id="0aaaa"><option id="0aaaa"></option></table>
    發布時間:2024-07-15 13:18 原文鏈接: 介紹一下ImmuneCellAtlas數據集的構建過程

    構建 Immune Cell Atlas 數據集通常涉及以下主要步驟: 

     1. 樣本采集:從不同個體、組織和疾病狀態中收集免疫細胞樣本。這可能包括健康人的外周血、淋巴組織,以及患有免疫相關疾病患者的病變組織等。 

     2. 單細胞分離:使用特定的技術,如流式細胞術或微流控技術,將單個免疫細胞從組織或細胞混合物中分離出來,以確保每個細胞的獨立性。 

     3. 文庫制備:對分離出的單細胞進行 RNA 提取,并通過反轉錄將 RNA 轉化為 cDNA。然后,添加特定的接頭和引物,構建測序文庫。 

     4. 單細胞測序:采用高通量測序技術,如單細胞 RNA 測序(scRNA-seq),對每個細胞的基因表達進行測序。 

     5. 數據質量控制:對測序得到的原始數據進行質量評估,去除低質量的讀段、檢測和糾正錯誤,以確保數據的準確性和可靠性。 

     6. 數據預處理:包括基因表達定量、數據標準化、去除批次效應等,以減少實驗和技術因素帶來的偏差。 

     7. 細胞注釋:根據基因表達特征和已知的免疫細胞標志物,對每個單細胞進行類型和狀態的注釋,確定其所屬的免疫細胞亞型。 

     8. 數據整合與存儲:將處理和注釋好的數據進行整合,并存儲在數據庫中,形成 Immune Cell Atlas 數據集,以便后續的分析和共享。 

     9. 持續更新與完善:隨著新的樣本和數據的加入,不斷更新和完善數據集,以提高其覆蓋范圍和代表性。 整個構建過程需要多學科的專業知識和技術,包括免疫學、分子生物學、生物信息學等,以確保數據集的質量和科學性。

    相關文章

    中國第三次冰川編目數據集發布

    在2025年3月21日首個“世界冰川日”召開的“第三屆全國冰凍圈科學大會”上,中國科學院西北生態環境資源研究院發布了中國第三次冰川編目數據集。西北研究院是我國最早從事冰川研究工作的科研單位,分別于20......

    我國第三次冰川編目數據集發布

    在3月21日首個“世界冰川日”召開的第三屆全國冰凍圈科學大會上,中國科學院西北生態環境資源研究院發布了中國第三次冰川編目數據集。根據第三次中國冰川編目,2020年前后中國最新冰川面積約為4.6萬平方千......

    每年主刀800臺手術,“大師姐”抽空發頂刊刷新歷史

    文|《中國科學報》記者李思輝實習生何睿她是一位知名三甲醫院的科室主任:不僅負責科室的管理工作,而且每周4個半天坐診,每年主刀800多臺手術;她是院士師門的“大師姐”:繁忙的臨床工作之余,做研究、帶學生......

    2024年張鋒團隊迎來首篇Cell

    Fanzor(Fz)是一種廣泛存在于真核生物結構域的ωRNA引導內切酶,具有獨特的基因編輯潛力。2024年8月28日,麻省理工學院/博德研究所張鋒團隊在Cell在線發表題為“Structuralins......

    創造新的記錄!西湖大學1天2篇Cell

    葉綠體蛋白在ATP酶馬達的驅動下,通過葉綠體外膜(TOC)轉座子和葉綠體內膜(TIC)超復合體的轉座子導入。Ycf2-FtsHi復合體已被確定為葉綠體進口馬達。然而,其在前蛋白轉運過程中與TIC復合物......

    半夜靈機一動,武大教授獲得一個神奇的“工具”

    文| 《中國科學報》記者李思輝實習生畢若雪“2021年暑假的一個凌晨,我突然靈機一動,思考了很久的一個模型突然清晰起來。我立即從床上蹦起來,花了5分鐘,在紙上把它清楚地畫了出來!”說起最近發......

    Cell和Wiley開放“一稿多投”系統涉及這些期刊

    “一稿多投”一直被認為是不端的行為,但這個“規矩”是在紙質時代信息溝通不暢的情況下制定的,近年來廣大作者呼吁取消這一觀念的聲音已振聾發聵!讓人欣喜的是,截止目前,已經有兩大國際知名出版社響應了這一呼吁......

    我國科學家構建目前最大活躍DNA轉座子數據集

    DNA轉座子也稱跳躍基因,可被用作基因工程工具。近日,中國科學院動物研究所張勇和王皓毅研究組開展了迄今為止最大規模的DNA轉座子活性篩選,構建了目前最大的活躍DNA轉座子數據集,極大擴展了基于DNA轉......

    北京理工大學,Cell+1

    2024年4月23日,北京理工大學生命學院肖振宇副教授、中國科學院動物研究所王紅梅、于樂謙、郭靖濤研究員、中國農業大學魏育蕾教授、鄭州大學第一附屬醫院何南南助理研究員在國際學術期刊Cell發表文章《3......

    高質量場景數據集將是人形機器人落地壁壘

    機器人硬件趨同趨勢顯現,具備高壁壘的核心硬件長期來看將是“香餑餑”,人形機器人能力的提升有賴于軟件能力的加強。高質量場景數據集會成為人形機器人落地的核心壁壘之一,謹防陷入“有多少人工,就有多少智能”的......

  • <noscript id="0aaaa"></noscript>
  • <noscript id="0aaaa"><kbd id="0aaaa"></kbd></noscript>
    <table id="0aaaa"><option id="0aaaa"></option></table>
    色av