1、糖異生原料的濃度對糖異生作用的調節：血漿中甘油、乳酸和氨基酸濃度增加時，使糖的異生作用增強。例如饑餓情況下，脂肪動員增加，組織蛋白質分解加強，血漿甘油和氨基酸增高；激烈運動時，血乳酸含量劇增，都可促進糖異生作用。
2、乙酰輔酶A濃度對糖異生的影響：乙酰輔酶A決定了丙酮酸代謝的方向，脂肪酸氧化分解產生大量的乙酰輔酶A可以抑制丙酮酸脫氫酶系，使丙酮酸大量蓄積，為糖異生提供原料，同時又可激活丙酮酸羧化酶，加速丙酮酸生成草酰乙酸，使糖異生作用增強。
此外乙酰CoA與草酰乙酸縮合生成檸檬酸由線粒體內透出而進入細胞液中，可以抑制磷酸果糖激酶，使果糖六磷酸酶活性升高，促進糖異生。