催化劑毛細管電泳儀分類有多種。
1、按分離目的可分：實驗室催化劑毛細管電泳儀和工業催化劑毛細管電泳儀。
2、按功能可分：分析型催化劑毛細管電泳儀和制備型催化劑毛細管電泳儀。
3、按靈敏性可分：微量催化劑毛細管電泳儀和痕量催化劑毛細管電泳儀。
4、按作用可分：催化劑定量分析毛細管電泳儀和催化劑定性分析毛細管電泳儀。
5、按分離規模可分：微型催化劑毛細管電泳儀、小型催化劑毛細管電泳儀和大型催化劑毛細管電泳儀。
6、按分離原理可分：催化劑毛細管色譜電泳儀、催化劑毛細管區帶電泳儀和催化劑毛細管凝膠電泳儀等。