光系統 Ⅰ（photosystemⅠ，簡稱 PSⅠ）
顆粒較小，直徑11nm，主要分布在類囊體膜（基質片層和基粒片層）的非垛疊部分；
PSⅠ核心復合體由反應中心色素P700（最大吸收波長為700nm）、電子受體和 PSⅠ捕光復合體（light harvesting complex Ⅰ，LHC Ⅰ）。
光系統 Ⅱ（photosystemⅡ，簡稱 PSⅡ）
顆粒較大，直徑約17.5nm，主要分布在類囊體膜（基粒片層）的垛疊部分；
PSⅡ主要由PSⅡ反應中心（PSⅡ reaction centre）、捕光復合體Ⅱ（light harvesting complex Ⅱ，LHC Ⅱ）和放氧復合體（oxygen-evoling complex，OEC）等亞單位組成。
PSⅡ反應中心色素為P680（最大吸收波長為680nm）。
PSⅡ的功能是利用光能氧化水和還原質體醌，這兩個反應分別在類囊體膜的兩側進行，即在腔一側氧化水釋放質子于腔內，在基質一側還原質體醌，于是在類囊體兩側建立氫離子梯度。