AAT具有多種遺傳分型，利用不同pH的緩沖劑和電泳支持物，迄今已分離鑒定有33種等位基因（allotypes），其中最多見的是PiMM型（為M型蛋白抑制物的純合子體）占人群的90%以上，另外還有兩種蛋白稱為Z型和S型，可表現為以下遺傳分型：PiZZ、PiSS、PiSZ、PiMZ、PiMS，S型蛋白與M蛋白之間的氨基酸殘基僅有一個差異。對蛋白酶的抑制作用主要限于血循環中M型蛋白的濃度。以MM型的蛋白酶抑制能力為100%相比，ZZ型的相對活力僅為15%、SS為60%、MZ為57%、MS為80%，其它則無活性。