胰膽合流異常是目前病因的流行學說，由美國醫生Babbit于1969年首次提出，即膽總管與胰管匯合于十二指腸壁外形成過長的胰膽合流共同管，胰液與膽汁可以在共同管內混合。正常情況下，膽總管與胰管匯合于十二指腸壁內，分別開口于十二指腸乳頭內，由于Oddi氏括約肌的作用，使膽汁和胰液直接流入十二指腸腔內而不會返流到膽管和胰管中。而胰膽合流異常的情況下，胰液和膽汁在共同管內混合，Oddi氏括約肌在共同管的遠端形成的高壓帶會導致胰液和膽汁的混合液體向膽總管和胰管內返流，即胰膽雙向返流：胰液返流入膽管，其內的胰蛋白酶、彈力纖維酶和膠原酶等會導致膽管管壁損傷，使其薄弱而發生擴張；另一方面膽汁流入胰管會導致胰酶激活，發生胰腺炎。