消化不良癥狀需與消化性潰瘍鑒別,有時兩者也可并存。十二指腸外的腫瘤如胰頭癌或巨大胰腺囊腫壓迫而引起十二指腸淤積,經內鏡檢查或逆行胰膽管造影術可予以區分。偶也可因腹主動脈瘤壓迫十二指腸引起本癥。本病也需與十二指腸內的結石、糞石、蛔蟲團、異物所致十二指腸梗阻相區別。