變形桿菌性肺炎在社區感染中罕見，院內感染中約占3.4%～5.8%。與其他革蘭陰性桿菌肺炎類似，主要是吸入口咽部定植的變形桿菌。正常人攜帶此菌很少，老年、使用抗酸劑或H2受體阻滯劑導致胃液pH升高、個人衛生狀況不佳、胃腸道手術者，口咽部變形桿菌定植增加。當機體抵抗力下降而吸入的菌量較多、毒力較強時，肺炎隨之發生。
變形桿菌性肺炎臨床表現缺乏特異性，常見癥狀為咳嗽、咳黏稠的黃痰、寒戰、發熱、胸痛、呼吸困難，個別病人可出現神經系統癥狀，如譫妄、四肢震顫等，但很少見。有時僅表現為輕中度的全身中毒癥狀如厭食、乏力、嗜睡、煩躁等。