高通量測序平臺(high-throughput_genome_sequence_database)
自從2005年454 Life Sciences公司(2007年該公司被Roche正式收購)推出了454 FLX焦磷酸測序平臺(454 FLX pyrosequencing platform)以來,曾推出過3730xlDNA測序儀(3730xl DNA Analyzer)的Applied BioSystem(ABI)這家一直占據著測序市場最大份額的公司的領先地位就開始動搖了,因為他們的拳頭產品毛細管陣列電泳測序儀系列(series capillary array electrophoresis sequencing machines)遇到了兩個強有力的競爭對手,一個就是羅氏公司(Roche)的454 測序儀(Roch GS FLX sequencer),,另一個就是2006年美國Illumina公司推出的Solexa基因組分析平臺(Genome Analyzer platform),為此,2007年ABI公司推出了自主研發的SOLiD 測序儀(ABI SOLiD sequencer)。這三個測序平臺即為高通量測序平臺的代表。
高通量測序技術已經由以凝膠板為基礎的方法(例如“S放射標記測序手冊、ABl 373、ABIPRISM 377、Li-corIR2型DNA測序儀)發展到毛細管測序儀(如ABI Prism 3100、3700和3730xl型DNA測序儀,Megabace1000和Megabace 5000)測序,已有關于制備DNA和測序的方法及設備的評論發表(Meldrum,2000a,b)。利用毛細管測序儀的轉變解決了凝膠板技術內在的通路追蹤問題,毛細管測序儀的自動化顯著提高了處理量,同時提供了更長的可測序長度。這些進展顯著增加了近些年產生的人類病原體的基因組數據。
TIGR尖端測序設備包括25臺ABIPrism 3700DNA分析儀、24臺AppliedBiosystems 3730xlDNA分析儀、6臺ABIPrism 3100DNA分析儀。約有50個項目在同時進行。在2001年進行的測序反應超過了3 400 000個,而到2002年底已完成了6 000 000個反應。TIGR現今的測序能力為每年14 000 000個測序流程。
科技日報北京8月15日電(記者張佳欣)據最新一期《自然》雜志報道,德國康斯坦茨大學和維爾茨堡大學領導的國際研究團隊,對動物界最大基因組的擁有者——肺魚進行了基因組測序。肺魚基因組約為人類基因組大小的3......
在南美洲發現的一種肺魚是迄今測序的擁有最大基因組的動物。8月14日,一項發表于《自然》的研究顯示,美洲肺魚的DNA包含了驚人的910億個化學堿基,是人類基因組的30倍。然而,這910億個堿基只包含與人......
近日,中國熱科院品資所牧草團隊在木豆農家種高質量基因組組裝及種子百粒重遺傳基礎解析方面取得新進展,該研究繪制了一個我國的木豆農家種D30高質量參考基因組,并通過全基因組關聯分析(GWAS)......
不同微生物的基因組指向了一個初級免疫系統的早期進化所有生物共有的最后一個祖先是一種生活在42億年前的微生物,其基因組相當龐大,編碼約2600種蛋白質,以氫氣和二氧化碳為食,并擁有一個抵御病毒入侵的基本......
7月8日,記者從西南大學獲悉,該校教授代方銀團隊首次獲得了家蠶W染色體完整基因組序列,并揭示了鱗翅目昆蟲W染色體起源與進化新機制。相關研究成果近日發表于期刊《科學進展》。家蠶性別的決定機制一直受到科學......
5月19日,重慶市農科院發布消息,該院果樹所柑橘創新團隊楊蕾、洪林、王敏、李霜等研究人員發布了國際首個血橙高質量基因組。相關研究成果以學術論文近日在國際期刊《科學數據》發表。楊蕾介紹,血橙是一種極具特......
5月19日,重慶市農科院發布消息,該院果樹所柑橘創新團隊楊蕾、洪林、王敏、李霜等研究人員發布了國際首個血橙高質量基因組。相關研究成果以學術論文近日在國際期刊《科學數據》發表。楊蕾介紹,血橙是一種極具特......
近日,我國科學家在葉下珠科藥用植物基因組研究方面取得新進展,研究揭示了多次雜交與多倍化事件共同塑造了葉下珠科復雜的物種形成歷史。相關成果發表于《植物學雜志》(ThePlantJournal)。葉下珠科......
記者6日從中國農業科學院獲悉,該院深圳農業基因組研究所農業生物轉錄組與代謝組創新團隊發表了首個人參端粒到端粒完整基因組,解析了人參重要活性成分——三萜皂苷的形成機制。相關研究成果日前發表于國際期刊《園......
一輪兇猛疫情肆虐多國。據央視新聞,巴西衛生部公布最新數據顯示,巴西2024年登革熱疑似及確診病例上升至4270624例,死亡病例2197例,另有2276名死亡病例待核查。另據西班牙媒體《20分鐘》報道......