PU引起的暖氣、反酸、惡心、嘔吐等癥狀容易誤診為妊娠反應，PU患者可有上腹部壓痛，但妊娠期上腹部壓痛亦可見于子宮及其附件甚至高位闌尾等處病變；PU發生并發癥是出現的體征，對診斷有幫助，擔妊娠期PU并發穿孔常無腹膜刺激癥；PU并發出血引起缺鐵性貧血，容易誤為妊娠期營養缺乏所致，如糞便潛血試驗陽性，應考慮PU并發出血；PU并發幽門梗阻發生嘔吐。
詳細了解其病史時診斷的基礎，根據患者有慢性病程、周期性發作、發作期和緩解期相交替的節律性上腹痛、夜間痛以及可用食物或制酸藥物緩解等典型癥狀不難診斷。但消化性潰瘍的確定診斷，需通過鋇餐X線和內鏡檢查才能建立，后者價值更優。部分患者亦可僅表現為無規律的上腹隱痛不適，臨床上孕婦就診時首先須區別是潰瘍病的癥狀還是正常妊娠反應或反流性食管炎癥狀。