結核性脊膜脊髓炎在臨床上仍需與脊髓蛛網膜炎及其他原因的亞急性脊髓炎相鑒別。
脊髓蛛網膜炎的癥狀常有起伏波動,脊柱X線片多正常,腦脊液蛋白質可輕度升高,但一般糖和氯化物均正常。
慢性或亞急性化膿性脊髓炎的腦脊液改變與結核性脊膜脊髓炎極難鑒別,應借助病史和脊髓MRI予以鑒別。