腸球菌原歸屬于鏈球菌科鏈球菌屬，又稱為D群鏈球菌或糞鏈球菌，為革蘭陽性菌。根據DNA同源性分析，現已將其另列一屬即腸球菌屬，主要包括糞腸球菌（EfaecaL，又稱糞鏈球菌）和類糞腸球菌（E，faecium又稱尿鏈球菌），并以前者致病多見。腸球菌一般不溶血，腸球菌耐鹽、耐熱，能在含6%NaCl的培養基中生長，在62℃高溫下也能生存30分鐘。腸球菌為人類消化道正常菌群，口咽部也能培養到糞腸球菌，致病力弱，一般情況下不致病。但侵入人體組織內可引起相應感染。寄生于口咽部的腸球菌若被誤吸入呼吸道，特別是鼻飼營養及機械通氣等治療時，則可能引起腸球菌肺炎其中，糞腸球菌致病的機會顯著高于類糞腸球菌。侵入性操作和廣泛使用廣譜抗生素與腸球菌的感染密切相關。