為了防止血液透析中凝血阻塞空纖維管道，影響透析的進行和降低透析治療的效果，需行抗凝措施。常用方法為給予肝素進行治療。但是肝素有抗凝作用，要防止患者有出血癥狀。那樣血液不凝集了。
⑴普通透析：首次肝素劑量為40～50mg（或0．8～1．2mg/kg）于靜脈穿刺時注入，以后追加5mg/h，透析前0．5～1小時停止追加肝素。有條件時應監測PTT或KPTT，使其保持在基礎值的180%較為合適。
⑵無肝素透析：
1）透析性（或血性）心包炎。
2）（1周內）手術，如心臟和血管手術，眼部手術及腎移植手術等。
3）顱內出血、消化道出血及其他部位活動性出血。
4）凝血功能障礙。
⑶低分子肝素：臨床上使用的有那屈肝素鈣（法安明，低分子肝素，速避凝）等，可替代肝素，效果同肝素相仿，但價格較貴。