DMD患者預后不良,在20歲左右死于呼吸衰竭或心力衰竭;LGMD的個別亞型和先天性肌營養不良癥預后也較差;BMD、FSHD、眼咽型肌營養不良癥和遠端型肌營養不良癥預后相對較好,喪失運動功能的時間較晚,部分患者壽命可接近正常人。