酵母蛋白是存在于天然酵母中的一種優質完全蛋白。酵母中的產朊假絲酵母(Candida utilis) 和啤酒酵母最早被人們利用作為食品，它們的蛋白質含量超過了干重的一半，但是必需氨基酸組成中相對缺乏含硫氨基酸，所以其生物價可因添加甲硫氨酸而增加。不過，由于酵母中含有較高量的核酸，若攝入過量的酵母蛋白則會造成尿酸的血液水平升高，引起機體的代謝紊亂。故此酵母蛋白很少直接作為人類食用蛋白質，一般它們可作為動物飼料蛋白進行必要的生物轉化，也可經化學分離提取其中的蛋白質或去掉核酸，再將蛋白質供給人類食用。酵母蛋白生產時常用的底物一般為碳水化合物。