醫學真菌學檢查是診斷真菌病的重要依據，隨著真菌感染病例的日益增多，對實驗室的診斷也提出了更高的要求。不論是患者淺部或深部感染診斷，幾乎全依賴于臨床標本的真菌學檢查。特別是系統性真菌感染，其早期特異的診斷方法是挽救患者生命的關鍵，而病原真菌的形態結構十分多樣，在不同條件下同一真菌也可有不同特點的形態。因此，在真菌的實驗室檢查中，必須熟練掌握各類真菌的形態特征以及在不同條件下的演變規律，才能獲得對致病真菌正確的診斷。目前真菌感染的實驗室檢查方法主要包括常規檢查法和特殊檢查法兩類。常規檢查法主要包括：①形態學檢查(直接鏡檢+染色鏡檢)。②培養檢查。③組織病理學檢查。特殊檢查主要包括：①血清學方法。②分子生物學方法。
一、進行真菌實驗室診斷的注意事項
①應有獨立實驗室，不應與其他細菌、病毒等實驗室共用，以防發生相互污染。②在每天工作前與工作后，工作臺均要以消毒水例如5%石碳酸或0.5%過氧乙酸
擦拭，如遇操作臺被真菌或標本污染，應即覆蓋紙巾，并用5%石碳酸消毒20min，切忌工作臺污染后即用水沖洗，以免污染擴散。③培養菌檢體及真菌污染的
物質在丟棄前，必須高壓滅菌或焚燒。④在進行真菌檢查時，不可試著聞平板培養基特殊的氣味。⑤不可對Histoplasma
capsulatum 以及 Coccidioides
immitis進行載玻片培養技術，因為其等具有高度感染性的孢子能夠隨著空氣傳播。⑥實驗室禁止任意養花、草、動物等生物，以防實驗污染。⑦工作環境應
定期消毒。一般紫外線照射不能殺滅真菌，應用40%甲醛(可于每4㎡空間用35ml
40%甲醛加18g高錳酸鉀在密閉情況下熏蒸24h，或用環氧乙烷進行消毒，每2～4周消毒1次。⑧如果用平板培養基接種標本，必須將平板培養基密封，以免發生危險，在不常做真菌檢測的實驗室，最安全的培養方法是利用含有棉花塞的試管培養基(使空氣能夠循環)。⑨美國梅育診所主張利用平板培養基進行真菌的分離，步驟如下：平板培養基必須在生物安全箱內操作及檢查。平板培養必須用膠帶封好，平板培養基必須含30ml的量，并保持培養箱60%以上的濕度，同時增加瓊脂的濃度至2%，以免脫水。⑩真菌的診斷，需要經驗的累積及備有良好的圖譜參考書。
二、分離及鑒定真菌的培養基
(一)配制培養基的一般原則
①各成分混勻后以文火緩慢加熱，并不斷攪拌，煮沸1min，過熱會破壞有效成分。②分裝試管應在高壓滅菌前，而分裝平皿應在高壓滅菌后。③高壓滅菌一般在118～121磅，10～15min。④需加血液或不能高壓的成分如抗生素，應在培養基冷卻至50左右時加入混勻。⑤試管分裝量約7~8ml，平皿約15ml，如需培養4～6周，平皿內應有35～40ml的量。培養基中抗生素的濃度和添加方法：氯霉素、慶大霉素和放線菌酮能耐熱，可在培養基高壓滅菌前加入，其他抗生素均在培養基高壓滅菌后冷卻至45℃～50℃時加入。青霉素20～100μg/ml，鏈霉素40～200μg/ml，氯霉素50μg/ml，放線菌酮500μg/ml，慶大霉素5μg/ml。
(二)分離和鑒定真菌的培養基
各種醫學真菌所用培養基的成分，又可根據不同要求，分成分離、富集、選擇、特性研究等含不同成分培養基，具體見表。
表 分離鑒定真菌培養基分類表
培養基種類 分離用培養基
使用目的
1.Brain heart infusion agar 分離腐生性及病原性真菌
2.Brain heart infusion agar with antibiotics 分離除了皮膚絲狀真菌以外的真菌
3.Brain heart infusion biphasic blood Culture bottles 從血液中分離真菌
4.Dermatophyte test medium 分離皮膚絲狀菌，建議僅做篩檢用
5.Inhibitory mold agar 分離除了皮膚絲狀真菌以外的真菌
6.Mycosel or mycobiotic agar 分離皮膚絲狀菌
7.Ssbouraud dextrose agar 分離腐生性及病原性真菌
8.Yeast estract phosphate agar 分離除了皮膚絲狀真菌以外的真菌
區分試驗培養基
1.Ascospore agar 檢測產子囊孢子酵母菌
2.Cornmeal agar with Tween 80 and trypan blue 檢測產厚膜孢子酵母菌
3.Cottonseed conversion agar 使雙相型真菌由霉菌型轉變為酵母型
4.Czapek’s agar 分離及區分Aspergillus spp
5.Niger seed agar 鑒定Cryptococcus neoformans
6.Nitrate reduction medium 檢測Cryptococcus spp.還原nitrate能力
7.Potato dextrose agar 證實Trichophyton rubrumm 產色素能力制作載玻片培養技術
8.Yeast fermentation broth 測定酵母菌的發酵能力
9.Yeast nitrogen base agar 測定酵母菌的糖類同化能力