2020年1月21日,中國科學院上海巴斯德研究所郝沛研究員、軍事醫學研究院國家應急防控藥物工程技術研究中心鐘武研究員和中科院分子植物卓越中心合成生物學重點實驗室李軒研究員合作,在SCIENCE CHINA Life Sciences(《中國科學:生命科學》英文版),在線發表了題為“Evolution of the novel coronavirus from the ongoing Wuhan outbreak and modeling of its spike protein for risk of human transmission”的論文。該文通過公布的基因組序列推測武漢冠狀病毒的自然宿主也可能是蝙蝠。
2020年2月3日,Nature雜志在線發表了兩篇關于新型冠狀病毒論文,它們分別是來自中國科學院武漢病毒研究所石正麗團隊題為“Pneumonia outbreak is associated with a novel coronavirus of likely bat origin”的研究論文;和來自復旦大學公共衛生學院張永振組題為“A new coronavirus associated with human respiratory disease in China”的研究論文,它們通過對病毒測序,發現新型冠狀病毒2019-nCoV為病原體,同時發現nCoV-2019病毒與SARSr-CoV有高度的序列相似性;然后,做了進化樹分析發現在整個基因組水平上,nCoV-2019與蝙蝠冠狀病毒的同源性為96%,證實了蝙蝠可能是該新型冠狀病毒的自然宿主(點擊查看)。
2020年1月22日,在Journal of medical virology雜志上發表了題為“Homologous recombination within the spike glycoprotein of the newly identified coronavirus may boost cross‐species transmission from snake to human”的研究論文。該研究通過與其他動物相比,基于蛇的RSCU偏差類似,表明蛇是造成當前2019-nCoV感染爆發的中間宿主(點擊查看)。
此外,2020年1月25日,北京大學朱懷球及浙江大學肖永紅共同通訊在bioRxiv 在線發表題為“Host and infectivity prediction of Wuhan 2019 novel coronavirus using deep learning algorithm”的研究論文,該研究預測表明,與感染其他脊椎動物的冠狀病毒相比,蝙蝠冠狀病毒被賦予2019-nCoV相似的感染模式。此外,通過比較脊椎動物宿主的所有病毒的感染模式,研究人員發現水貂病毒顯示出與2019-nCov更為接近的感染模式。傳染性模式分析的這些結果表明,水貂可能是2019-nCov的中間宿主。