單核吞噬細胞系統(mononeuclear phagocyte system)又稱單核巨噬細胞系統，是高等動物體內具有強烈吞噬能力的巨噬細胞，及其前身細胞所組成的一個細胞系統，是機體防御結構的重要組成部分。
巨噬細胞細胞質內含豐富溶酶體、線粒體及粗糙內質網，細胞表面形成小突起和胞膜皺褶。靜止時稱固著巨噬細胞，有趨化因子時便成為游走巨噬細胞，能進行變形運動及吞噬活動。人的巨噬細胞能生活數月至數年。許多疾病能引起單核吞噬細胞系統大量增生，表現為肝、脾淋巴結腫大。功能為吞噬清除體內病菌異物及衰老傷亡細胞；活化T.B.淋巴細胞免疫反應。在細菌或其他因子刺激下能分泌酸性水解酶、中性蛋白酶、溶菌酶和其他內源性熱原等。該系統包括單核細胞，結締組織跟淋巴組織中的巨噬細胞、肝的庫普弗細胞、肺的塵細胞、神經組織的小膠質細胞、骨組織的破骨細胞和骨髓中的原單核細胞、幼單核細胞，單核細胞穿出血管壁進入其他組織中，分別分化為上述各種細胞。