人類
據文獻報道，變形桿菌引起急性胃腸炎，食物中毒潛伏期最短為2h，最長30h，一般為10-12h，病人癥狀主要為頭痛、頭暈、惡心、嘔吐、陣發性劇烈腹痛、腹瀉、水樣便、體溫37.8-40℃，一般多在39℃以下，伴全身無力。腹痛為絞痛，腹瀉物為稀便和水樣便，腹瀉物有特殊臭味，一日可多達10余次。病程一般1-2d，多者可達3-4d，愈后一般良好。
P. m廣泛分布于自然界和人與動物體表，是一種較常見的條件致病菌。一般不致病，但在人或動物體內或體表的適宜環境生長，且奇異變形桿菌數>1X106CFU/g時，就構成感染致病量，可誘發尿道炎、削尿道結石、腎盂腎炎、中耳炎、菌血癥及小兒急、慢性腹瀉、脊髓炎等多種疾病，嚴重時可致死。特別是被污染的熟肉制品不經過加熱或加熱不徹底，極易造成食物中毒，應該引起足夠的重視。最近還有文獻報道，類風濕性關節炎患者血清抗P. m抗體效價顯著升；成人慢性腹瀉與腸道P. m等需氧菌群優勢生長有關。
動物
動物感染后輕者精神不振、食欲減退、多臥少動、嘔吐、排淺黃色或粉紅色糞便。重者嚴重腹瀉，一日數次，糞便短時間內由淺黃色漸變為粉紅色，最后為咖啡色，腥臭，有的呈膠胨狀；腹痛，垂頭閉眼，蜷縮伏地，精神沉郁；站立時抽腹弓背，兩眼發呆深陷；食欲廢絕，排乳白色尿液，體溫39.5-41.3℃，呼吸急促，被毛粗亂無光澤。