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    發布時間:2020-08-10 22:20 原文鏈接: 噬菌體DNA在濾膜上的雜交實驗

    實驗方法原理 通過用 32P 標記探針的原位雜交,可篩選攜帶有固定化 DNA 的濾膜,這些 DNA 來源于噬菌斑。該技術是強有力的、高度特異的和很靈敏的,能從數千個噬菌斑中鑒別出單一的重組子。

    實驗材料 噬菌體 DNA放射性標記探針

    試劑、試劑盒 氯仿預雜交液SMSSPE

    儀器、耗材 煮沸的水浴玻璃(Pyrex ) 烘烤平皿或其他雜交器皿膠水培養箱放射性墨Whatman 3 MM 紙

    實驗步驟

    一、材料


    1. 緩沖液和溶液


    氯仿


    預雜交液


    SM


    2X SSPE


    洗液 1(2X SSC,0.1% (m/V) SDS)


    洗液 2(1X SSC,0.1% (m/V) SDS)


    洗液 3(0.1X SSC,0.1% (m/V) SDS)


    2. 核酸和寡核苷酸


    固定于膜上的噬菌體 DNA


    放射性標記探針


    3. 專用設備


    煮沸的水浴(用于雙鏈探針變性)


    玻璃(Pyrex ) 烘烤平皿或其他雜交器皿


    膠水,水溶性(如 FaberCastell 公司的 UHU Stic)


    預置于適宜雜交溫度的培養箱


    放射性墨


    Whatman 3 MM 紙


    二、方法


    1. 如果濾膜是干的,將經烘烤或交聯的濾膜漂浮在 2X SSPE 表面,直到自下而上完全濕透,再將濾膜浸沒 5 min。


    2. 將濾膜轉移至含有預雜交液的 Pyrex 平皿或其他雜交器皿中,每張 82 mm 濾膜用 3 ml 預雜交液或每張 132 mm 濾膜用 5 ml 預雜交液。將濾膜置搖床中于適宜的溫度下(即在水溶液中雜交為 68℃,在 50% 的甲酰胺溶液中雜交則為 42℃)溫和地振搖 1~2 h 或更長。


    3. 通過 100℃ 加熱 5 min 變性 32P 標記的雙鏈探針,然后置冰水浴快速冷卻,而單鏈探針不需要變性。


    4. 將變性探針加入至浸泡了濾膜的預雜交液中,在適宜的溫度下溫育 12~16 h。


    5. 當雜交完成后,將濾膜快速從雜交液中取出,立即浸入放置于室溫的大體積(300~500 ml ) 洗液 1 中。輕輕晃動濾膜,且在清洗過程至少翻動一次。5 min 后,轉移至新鮮的洗液中,繼續輕輕晃動。再重復漂洗過程兩次。


    6. 在 68℃ 于 300~500 ml 的洗液 2 中漂洗兩次,時間為 1~1.5 h。


    7. 將濾膜置于 Whatman 3 MM 濾紙或紙巾上,在室溫風干。在濾膜的背面貼上水溶性膠水,然后排列在一張干凈、干燥、平整的 3 MM 濾紙上(編號的一面朝上),并用力壓濾膜,使其粘在濾紙上而無法移動。在 3 MM 濾紙上選數個非對稱的點,滴上放射性墨汁或化學發光標記。這些標記被用于對齊放射自顯影與濾膜。用 Saran 公司的包裝膜(Wrap/Cling Film) 蓋住濾膜和標記。用膠帶將包裝膜在 3 MM 濾紙的背面封住,將濾紙上的包裝膜拉直,防止起皺。


    8. 將濾膜進行 X 射線片(Kodak 公司 XAR-2、XAR-5 或相當產品)曝光,帶增感屏 -70℃ 曝光 12~16 h。


    9. 將 X 射線片顯影,根據放射性墨汁或化學發光標記與濾膜對齊,然后用非放射性的紅色纖維尖頭筆在 X 射線片的相應位置標上對應于編號濾膜的非對稱性點。


    10. 通過與瓊脂平板上方向標記的比對找到陽性克隆。


    11. 挑取陽性克隆,并保存于含 1 滴(50 μl ) 氯仿的 1 ml SM 中。


    12. 為了純化雜交陽性的噬菌斑,將從扣取瓊脂塊上回收到的噬菌體組分(通常為 50 μl 10-2 稀釋液)鋪平板培養,隨后進行新一輪的雜交篩選。


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