(1) 采樣點不宜設在田邊、溝邊、路邊或肥堆邊；采樣時要首先清除表層的枯枝落葉，有植物生長的點位要首先除去植物及其根系。采樣現場要剔除礫石等異物。要注意及時清潔采樣工具，避免交叉污染。
(2) 每個采樣點的取土深度及采樣量應均勻一致，土壤上層與下層的比例要相同。取樣器應垂直于地面入土，深度相同。用取土鏟取樣應先鏟出一個耕層斷面，再平行于斷面下鏟取土。
(3) 測定微量元素的樣品必須用不銹鋼取土器采樣。
(4) 測定重金屬的樣品，盡量用竹鏟、竹片直接采取樣品，或用鐵鏟、土鉆挖掘后，用竹片刮去與金屬采樣器接觸的部分，再用竹片采取樣品。對于污染土壤的樣品，要根據污染物的性質采取相應的防護措施，避免與人身體的直接接觸。
(5）采集揮發性、半揮發性有機物樣品時，要防止待測物質揮發，注意樣品滿瓶不留空隙，低溫運輸和保存。