原因可能是以下幾點
一種情況：滅菌前加熱溶解過程中出現難溶物，這可能是水質不佳（偏酸或偏堿或含有容易形成難溶物質的金屬離子；
另一種情況：滅菌前澄清滅菌后有沉淀析出，這可能與滅菌條件有關，溫度過高，使培養基里面的某些成分變性形成沉淀，也有可能是容器不干凈（如新玻璃瓶未經處理）就會游離出一些堿性物質與培養基的某些成分發生化學反應生成難溶性物質。
再有一種情況：滅菌前不經過加熱溶解過程而是直接滅菌，滅菌過程中某些成分局部濃度過高也會發生化學反應生成難溶性物質；
還有一種情況 就是配方中含有的離子成份過多，培養基會或多或少存在一些沉淀。