復旦大學Nature子刊發布環狀RNA重要發現

　　來自復旦大學、上海交通大學醫學院的研究人員借助分析環狀RNA，揭示出了豐富的circHIPK3通過像海綿般結合多種miRNAs調控了細胞生長。這一重要的研究發現發布在4月6日的《自然通訊》（Nature Communications）雜志上。

　　復旦大學的黃勝林（Shenglin Huang）研究員及何祥火（Xianghuo He）教授是這篇論文的共同通訊作者。前者主要從事消化系統腫瘤發病的分子機制研究。后者主要從事消化系惡性腫瘤發生于轉移的分子機理研究。

　　環狀RNA(circRNAs)是近年來RNA領域最新的研究熱點，它是一類由特殊的選擇性剪切產生且在真核細胞中廣泛表達的環形內源性RNA分子。circRNA表達具有組織特異性，其獨特的環狀結構使其能夠逃逸RNAse酶的降解，具有很強的胞內穩定性，能夠長效行使轉錄調控者的職能。但目前對于人類circRNAs的調控及功能仍知之甚少。

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　　在這篇文章中研究人員報告稱，他們生成了來自6種正常組織和7種癌癥的ribominus RNA測序數據，檢測了至少2.7萬個候選circRNA。發現其中許多的circRNAs在正常與癌組織之間呈差異表達。他們進一步確定了源自HIPK3基因外顯子2（Exon2）的一種豐富的circRNA：circHIPK3的特征。證實沉默circHIPK3而非HIPK3 mRNA可顯著抑制人類細胞生長。通過熒光素酶篩查分析，研究人員觀察到circHIPK3像海綿一樣吸附結合了具有18個潛在結合位點的9種miRNAs。具體說來，他們證實circHIPK3直接結合miR-124，并抑制了miR-124活性。

　　這些研究結果提供了令人信服的證據證實，由前體mRNA生成的環狀RNA在人類細胞中發揮了重要的調控作用。

　　由貝斯以色列女執事醫療中心(BIDMC)領導的一個研究小組在2016年3月的Cell雜志上揭示出，就像蛋白質一樣，在癌癥中環狀RNAs也受到基因組重排的影響，導致了異常的融合。并且，這些融合-環狀RNAs不僅僅是旁觀者；它們似乎促進了腫瘤生長和進展，凸顯了它們在疾病中的作用。

　　理論上，一個線性mRNA衍生的假基因會與它的親本線性mRNA保持相同的外顯子先后順序。相比之下，circRNA衍生的假基因將會具有倒序的外顯子 -外顯子連接點 (Exon-exon junction, EEJ)。利用這一特征，中科院上海生命科學研究院的楊力博士領導研究人員，在小鼠和人類基因組中鑒別出了一些潛在的circRNAs衍生假基因。研究結果發布在2016年3月的Cell Research雜志上。

　　來自中國科技大學、華中師范大學等處的研究人員報告稱，他們鑒別出了一類與RNA聚合酶Ⅱ相關的環狀RNA（circRNAs），將之命名為外顯子-內含子circRNAs（EIciRNAs）。并證實這些EIciRNAs調控了細胞核中的轉錄。這些研究成果在線發表在2016年2月的《Nature Structural & Molecular Biology》雜志上。