多重PCR技術具備單個反應體系檢測多種靶標的能力,但是如果需要鑒別反應體系中的不同靶標基因，則需要針對不同的靶標，設計特異性的探針并標記熒光基團，不同的靶標標記不同的熒光基團。為了避免熒光基團之間的相互干擾，應合理選擇不同光譜范圍的熒光基團。熒光基團應與使用的熒光定量PCR儀器具有適配性，每個熒光通道進行單個靶標基因的讀取。考慮到PCR儀熒光串擾問題以及反應體系中引物探針互相的干擾作用,目前市面上的PCR儀最多支持4個通道檢測，即單管鑒別4個靶標基因。
如何突破多重PCR技術瓶頸，破解單通道只能鑒別單個靶標基因的難題?-種基于熒光定量PCR平臺的新型多重熒光PCR技術被開發并獲得了國家知識產權局頒發的發明ZL證書。該方法將傳統的實時熒光定量PCR法與PCR熔解曲線法相結合，在同一個熒光通道，針對一個靶標基因設計特異性引物以及特異性熒光探針，另一個靶標基因采用ZL特殊的寡聚核苷酸修飾技術。從而實現在一個熒光通道中進行多個靶點的同時檢測，極大地增加了常規熒光PCR儀器的檢測通量，為臨床的多病原體檢測提供更為有力的工具。