根據協議,大灣區大學–香港中文大學先進材料與綠色能源研究院,又稱Great Bay University – The Chinese University of Hong Kong Joint Institute of Advanced Materials and Green Energy Research,是大灣區大學下屬的二級機構,將實行理事會領導下的院長負責制,接受兩校共同管理。未來大灣區大學將在學生培養、人才儲備、科研發展等方面與香港中文大學展開深入交流合作。依托研究院雙方將深入貫徹國家粵港澳大灣區發展戰略,面向大灣區科技創新發展需求,共同打造國際一流的創新綠色科技產學研基地,大力培養先進材料與綠色能源研發的卓越人才。雙方將持續探索有利于大灣區科技創新發展和人才培養的研究院管理體制,構建以創新科研及協作研發為主,同時融合創新人才培養模式為一體的新型創新科研合作平臺。