1.進樣閥殘余峰 每次用后用強溶劑清洗閥,改進閥和樣品的清洗
2.樣品中未知物 處理樣品
3.柱未平衡 重新平衡柱,用流動相作樣品溶劑 尤其是離子對色譜
4.三氟乙酸TFA氧化肽譜 每天新配,用抗氧化劑
5.水污染反相 通過變化平衡時間檢查水質量,用HPLC級的水