實驗材料 細胞和組織
試劑、試劑盒 氯仿氯化銫溶液二硫蘇糖醇EDTA乙醇異硫氰酸胍裂解緩沖液異丙醇N-月桂酰肌氨酸氯化鋰液氮β-巰基乙醇苯酚
儀器、耗材 離心機和轉子研缽和杵超速離心管
實驗步驟
一、材料
1. 緩沖液、溶液和試劑
氯仿
氯化銫溶液,5.7mol/L(5.7mol/L 氯化銫,25 mmol/L 醋酸鈉,pH6.0,1mmol/LEDTA,pH8.0)
用焦碳酸二乙酯(DEPC) 處理過的水
二硫蘇糖醇(DTT),0.2 mmol/L
EDTA,1mmol/L,pH8.0
乙醇,70%(體積分數)
異硫氰酸胍裂解緩沖液 (4mol/L 異硫氰酸胍,25 mmol/L 醋酸鈉,pH6.0,1mmol/LEDTA,pH8.0)
異丙醇
N-月桂酰肌氨酸,20%(200 g/L)
氯化鋰(LiCl),8mol/L
液氮
β-巰基乙醇,10 ml/L
苯酚, 水飽和,pH4.0
2. 離心機和轉子
BeckmanTi50 轉子或相當的轉子
3. 特殊設備
研缽和杵,用 DEPC 處理過的水洗滌,預冷
超速離心管(異質同晶共聚材料),或相當的 Polygon, 或相當的高速勻漿器
4. 細胞和組織
細胞/組織,凍于液氮
二、方法
1. 使用研缽和杵在液氮下將樣品研磨成細粉。使用 Polygon 均化器或其他合適的器具在 7 ml 胍裂解緩沖液中均質化組織或細胞(達 1X109 個)。
2. 將 4 ml5.7mol/L 的 CsCl 溶液加到超速離心管中。
3. 將 1ml5.7mol/L 的 CsCl 溶液、120ul10mol/L 的沒-巰基乙醇和 240ulN-月桂酰肌氨酸加到裂解產物中。
4. 將氯化銫/裂解產物混合物混合,小心使之位于離心管中的氯化銫溶液上分層。
5.20°C 下 180000 g 離心 21 h。
6. 移棄氯化銫上清液,小心避免擾動管底的 RNA 沉降物。
7. 小心將 RNA 沉降物再溶解于 750ul 異硫氰酸胍裂解緩沖液中。
8. 加等體積酚,混勻。
9.10000g 離心 15 min。
10. 將水相轉移到一新管中。重復水相的酚抽提,直到界面變清。
11. 向清澈的水相加 1 倍體積氯仿。
12. 混合,l0000 g 離心 l0 min。
13. 將水相轉移到一干凈試管中。加等體積的異丙酵和 1/10 體積 8mol/L 的氯化鋰。10000g 離心10min。
14. 移棄上清液。用 750ul70% 乙醇洗滌 RNA 沉降物,10000 g 離心。
15. 移棄乙酵,風干沉降物,再溶解于 50~500ul0.2 mmol/L 的 DTT 中。
16.RNA 儲存于-70°C。