對于錯過非手術矯形時機的患兒或矯形后由于未按照醫囑要求佩戴矯形支具造成畸形復發的患兒，則根據其不同的情況進行相應的對癥手術治療。
（1）廣泛軟組織松解術：手術方法包括Turco、Mckay、Carroll等方法，是針對足踝攣縮的軟組織進行松解，恢復跗骨間正常解剖結構。任何一期廣泛性松解治療馬蹄內翻足的一般原則包括：
1)手術完成時松開止血帶，并電凝止血；
2)必要時使足處于跖屈位，仔細地縫合皮下組織和皮膚，以免皮膚張力過大；
3)術后2周首次更換石膏時，可把足置于完全矯正的位置。
（2）跟腱延長術：對于錯過跟腱松解手術年齡的患兒（一般2～3歲）需要將松解跟腱，使跟骨下落要進行跟腱延長術，將跟腱行Z字切開。術后石膏固定6周。
（3）脛前肌外移術：適用于馬蹄足早期輕度復發，或治療后殘留前足內收畸形的兒童。
（4）外固定支架：對于大齡僵硬性馬蹄內翻足患兒（一般5歲以上），足部骨骼已經骨化，單純通過軟組織無法矯正畸形，可使用外固定支架技術，術后需要定期調節支架，外觀基本滿意，但會殘留足踝關節僵硬。
（5）足部截骨矯形術：有很多手術方式，一般患兒年齡大于5歲，根據其畸形情況選擇不同部位的截骨，可與外固定支架聯合矯正馬蹄內翻畸形。
（6）三關節融合術：適應證為10歲以上兒童；合并跖骨內收、后足內翻、跖屈三種畸形；可以考慮行此手術。
手術治療應考慮到肢體的發育生長因素，手術矯正可分次進行，破壞性不宜太大。