（1）手術切除 胰腺假性囊腫囊壁由炎癥纖維結締組織構成，與周圍臟器緊密粘連，勉強分離易導致出血和周圍臟器損傷，施行切除指征僅限于：①慢性胰腺炎 誘發的交通性且伴胰管梗阻的慢性胰腺假性囊腫。此類囊腫外引流往往無效內引流復發率又高；②胰尾部多房性胰腺假性囊腫 內外引流均效果不佳；③對于胰頭部的囊腫 如不能排除腫瘤性囊腫或同時考慮治療慢性胰腺炎因素時，方可行胰十二指腸切除；胰尾部胰腺假性囊腫可行胰尾部切除如囊腫與脾臟粘連緊密強行分離易導致大出血，特別是30歲以上的成年人可考慮行囊腫、胰尾、脾一并切除。
（2）內引流術 凡直徑>厘米，囊壁成熟的囊腫。一般將時間定為6周，因為6周以上囊壁已經堅厚，且不易自然消退，CT掃描對判斷囊壁是否成熟有重要價值；慢性胰腺假性囊腫特別與胰管相通且伴胰管狹窄者，可考慮行此術。
（3）手術吻合 ①囊腫十二指腸吻合術 囊腫十二指腸吻合易出現出血、膽瘺、胰瘺等嚴重并發癥，因此選擇要慎重，操作需仔細。②囊腫胃吻合術 優點是胃強有力的蠕動，有助于囊腫排空，加速囊壁的塌陷，同時胃內容進入囊腔可抑制胰腺各種酶的活動，防止酶對囊壁的腐蝕，缺點是未經消化的胃內容進入囊腔，造成囊腔繼發感染堿性胰酶進入胃內刺激胃竇導致胃泌素大量分泌，可誘發潰瘍病的發生。
（4）外引流術 有眾多缺點易腐蝕皮膚，會丟失大量水、電解質，蛋白質及胰液，術后處理較為困難，囊腫復發率21%～28%，方法：①造袋術 此法除了具有外引流的所有缺點外需每天換藥易逆行感染，切口愈合困難，且極易形成胰瘺，因此僅用于全身情況極差，囊壁與腹壁很貼近，且囊壁甚薄的患者。②囊腫蘑菇管或T管引流術 找到囊腫，切開且處理囊內容后，安置T管或蘑菇引流管，間斷全層關閉囊腫切口。引流管穿過大網膜，另戳孔引出體外。本法可避免對皮膚的腐蝕且毋需每天換藥，可減少逆行感染，亦不會影響切口愈合。
（5）近年來采用囊腫胃內外一期引流術和囊腫空腸Roux-en-Y內外一期引流術 取得了較滿意的療效。此法既有內引流和外引流各自的優點又可摒棄兩者的缺點。