木棉的拉丁名，國外最早在1954年被提及的為Bombax malabaricum，至2015為止，均較為廣泛的在化學成分、藥理分析、植物研究等文獻中使用，在《中國植物志》中，亦使用此拉丁名；《海南植物志》《廣州植物志》等地方植物志及《中國高等植物圖鑒》等則較多使用Gossampinus malabarica這一拉丁名。英文版《Flora of China》及一些文獻則寫為Bombax ceiba。依照植物命名規則，木棉的命名應該是唯一的。所以在后來，植物分類學界認為Bombax ceiba才是木棉的標準拉丁名。