在依賴ρ因子終止的轉錄中，產物RNA的3'-端會依照 DNA 模板，產生較豐富而且有規律的C堿基。ρ因子正是識別產物 RNA 上這些終止信號序列，并與之結合。結合 RNA后的ρ因子和 RNA pol都可發生構象變化，從而使RNA pol的移動停頓，ρ因子中的解旋酶活性使 DNA/RNA 雜化雙鏈拆離，RNA產物從轉錄復合物中釋放，轉錄終止。
