1、腦血管或冠狀動脈病變患者、低血壓者慎用、癲癇患者慎用。（米索前列前列醇僅應在癲癇得到控制或用藥利大于弊時才能使用）。
2、兒童使用米索前列醇的安全性和療效尚未確定。
3、米索前列醇對妊娠子宮有收縮作用，除用于終止早孕外，孕婦禁用。婦女使用米索前列前列醇治療開始前2周內血清妊娠實驗必須是陰性。用藥期間婦女必須使用有效的避孕方法；若懷疑妊娠，應立即停用米索前列前列醇。
4、米索前列醇的活性代謝物是否可經乳汁排泄尚不清楚，因此不應用于哺乳期婦女。
5、米索前列醇可引起腹瀉，對高危患者，應監測有無脫水。
6、米索前列醇用于終止早孕時，必須與米非司酮序貫配伍應用，且必須按藥物流產常規的要求進行觀察和隨訪。
7、米索前列醇用于消化道潰瘍時，治療是否成功不應以癥狀學進行判斷。
8、過量用藥時出現的癥狀是可以忍受的。米索前列醇每天用1200mg，持續使用3個月，未發現嚴重不良反應。