所謂酶工程法即利用酶催化的立體專一性反應，以奎尼酸化學合成的中間體為底物制備具有光學活性的奎尼酸。酶工程法可高選擇性、高收率地獲得所需要的光學活性物質，具有工藝簡單、周期短、耗能低、專一性強、收率高等特點，但要將它應用于工業化生產，還涉及到底物的價格和酶源兩個問題。隨著基因工程的迅速發展，酶源的獲得不再成為問題，關鍵在于如何獲得廉價的底物。奎尼酸的前體物脫氫奎尼酸和中間體莽草酸等經過酶法轉化可合成奎尼酸5 但脫氫奎尼酸和莽草酸的價格比較貴，故通過該法獲得奎尼酸也未能大量開展。
