對AIDS的治療目前尚無特效方法，胸腺素、轉移因子、輸注白細胞、干擾素及骨髓移植均難以奏效。Rubinstein等試用去血漿法和（或）靜脈注射人血丙種球蛋白在嬰兒中的初步結果表明，有預防感染及阻止免疫狀態進一步惡化的作用，目前認為蘇拉明（Suramin）具有較好的療效。此外，控制機會性感染也很重要，根據不同病原采用各種治療方法：
1.卡氏肺囊蟲肺炎
推薦用磺胺甲惡唑（SMZ）+甲氧芐啶（TMP）或噴他脒（戊烷脒）治療。
2.單純皰疹病毒
感染者可用阿昔洛韋（無環鳥苷）治療，有較好療效。
3.白色念珠菌
口腔有持續性白色念珠菌感染用甲紫（龍膽紫）或制霉菌素等常規治療，無效可口服酮康唑有效，但停藥后可復發。