慢性非細菌性前列腺炎應采取綜合治療。治療目標主要是緩解疼痛、改善排尿癥狀和提高生活質量。
1.一般治療
健康教育、心理和行為輔導有積極作用。患者應戒酒，忌辛辣刺激食物；避免憋尿、久坐，注意保暖，加強體育鍛煉。
2.藥物治療
最常用的藥物是抗生素、α-受體阻滯劑、植物制劑和非甾體抗炎鎮痛藥，其他藥物對緩解癥狀也有不同程度的療效。
（1）抗生素目前，在治療慢性非細菌性前列腺炎的臨床實踐中，最常用的一線藥物是抗生素，但是只有約5%的慢性前列腺炎患者有明確的細菌感染。①炎癥型抗生素治療大多為經驗性治療，理論基礎是推測某些常規培養陰性的病原體導致了該型炎癥的發生。因此，推薦先口服氟喹諾酮等抗生素2～4周，然后根據療效反饋決定是否繼續抗生素治療。只在臨床癥狀確有減輕時，才建議繼續應用抗生素。推薦的總療程為4～6周。②非炎癥型不推薦使用抗生素治療。
（2）α-受體阻滯劑α-受體阻滯劑能松弛前列腺和膀胱等部位的平滑肌而改善下尿路癥狀和疼痛，因而成為治療慢性前列腺炎的基本藥物。
可根據患者的情況選擇不同的α-受體阻滯劑。推薦使用的α-受體阻滯劑主要有：多沙唑嗪、萘哌地爾、坦索羅辛和特拉唑嗪等，對照研究結果顯示上述藥物對患者的排尿癥狀、疼痛及生活質量指數等有不同程度的改善。
（3）植物制劑植物制劑在慢性前列腺炎中的治療作用日益受到重視，為推薦的治療藥物。植物制劑主要指花粉類制劑與植物提取物，其藥理作用較為廣泛，如非特異性抗炎、抗水腫、促進膀胱逼尿肌收縮與尿道平滑肌松弛等作用。推薦使用的植物制劑有：普適泰、沙巴棕及其浸膏等。由于品種較多，其用法用量需依據患者的具體病情而定，通常療程以月為單位。不良反應較小。
（4）非甾體抗炎鎮痛藥非甾體抗炎鎮痛藥是治療慢性非細菌性前列腺炎相關癥狀的經驗性用藥。其主要目的是緩解疼痛和不適。
（5）M-受體阻滯劑對表現如尿急、尿頻和夜尿但無尿路梗阻的前列腺炎患者，可以使用M-受體阻滯劑（如托特羅定等）治療。
（6）抗抑郁藥及抗焦慮藥對合并抑郁、焦慮等心境障礙的慢性前列腺炎患者，在治療前列腺炎的同時，可選擇使用抗抑郁藥及抗焦慮藥治療。這些藥物既可以改善患者心境障礙癥狀，還可緩解排尿異常與疼痛等軀體癥狀。應用時必須注意這些藥物的處方規定和藥物不良反應。可選擇的抗抑郁藥及抗焦慮藥主要有選擇性5-羥色胺再攝取抑制劑、三環類抗抑郁劑等藥物。
（7）中醫中藥推薦按照中醫藥學會或中西醫結合學會有關規范進行前列腺炎的中醫中藥治療