研究發現RNA測序新方法：檢測亞細胞水平轉錄組空間分布

　　斯坦福大學研究團隊在RNA測序方面取得突破性進展，發明了一種亞細胞水平轉錄組空間分布的RNA測序新方法，研究論文于近日在線發表于國際期刊Cell，論文標題為“Atlas of subcellular RNA localization revealed by APEX-Seq”。

　　該研究發明了一種名為APEX-Seq的RNA測序技術，通過基因編碼的過氧化氫酶APEX2（engineered ascorbate peroxidase 2）經過H2O2催化1分鐘后，直接在活細胞內對指定區域（利用特異性融合蛋白或定位信號將APEX定位在目標區域）的RNA進行高精度的生物素標記，利用親和素修飾的磁珠對標記的RNA富集以進行深度測序。該研究對包括細胞核、核孔、核纖層、核仁、細胞質、內質網外膜、內質網內膜、線粒體基質、線粒體外膜在內的9個亞細胞區域/結構的RNA組成進行了全面的分析，繪制了HEK293細胞內以這9個位置為坐標的轉錄組空間分布圖譜，以及細胞在不同刺激下部分區域RNA分布的動態變化。