離子色譜儀電化學檢測器有電導檢測器和安培檢測器等。
一、電導檢測器：
電導檢測器是檢測具有電導性化合物的通用型檢測器，是離子色譜儀最常用的檢測器。
電導率是指在陰極和陽極之間的離子化溶液傳導電流的能力。溶液中的離子越多，在兩電極間通過的電流越大。低濃度時，電導率與溶液中導電物質的濃度成正比。
電導檢測器主要用于檢測無機陰、陽離子和部分極性有機化合物，如一些羧酸。各種強酸、強堿的陰、陽離子，如氯離子、硫酸根、鈉離子和鉀離子在電導檢測器上都有很好的靈敏度。一些弱酸離子由于其不完全電離，測定的靈敏度較低。
二、安培檢測器：
安培檢測器是一種用于檢測電活性分子在工作電極表面發生氧化或還原反應時所產生電流變化的檢測器，常用于分析離解度低，用電導檢測器難于檢測或根本無法檢測的離子。
直流安培檢測器具有很高的靈敏度，可以檢測ug/L級無機和有機離子。
積分安培檢測器主要用于檢測醇、醛、胺、含硫基團、糖類有機化合物和硫化物。