穩定輸出，樣本DNA提取案例分享

最近實驗室的師兄師姐們反饋，試用了MP的兩款柱膜法新品試劑盒（SPINeasy DNA Kit for Soil和SPINeasy DNA Kit for Feces）都得到比較理想的實驗數據，問了一圈身邊的科研小伙伴們，認為操作簡便，提取DNA純度高、收率好的試劑盒為優先考慮購買的上上之選。下面小編與大家分享下部分類型樣本DNA提取的實驗成果吧~
 

【土壤與沉積物樣本】

針對土壤和沉積物型樣本DNA提取，實驗中大家選擇了使用土壤基因組DNA提取試劑盒（柱膜法）SPINeasy DNA Kit for Soil（貨號 116530050），操作簡便快捷，同時樣本應用范圍廣泛。

案例分享1

樣本類型：高原植物根系土壤

面臨挑戰：提取高原植物根系土壤，含腐植酸較高。對比了若干款進口和國產DNA試劑盒后，存在DNA提取純度低太低問題。

試用結果數據：

試用體驗：
1、提取時間大大縮短；
2、操作相對比較簡便；
3、提取效果相對較好，降解減少；
4、260/230有所提高，雜質減少。
 

案例分享2
 

圖源  中國科學院城市環境研究所

樣本類型：蚯蚓腸道內容物和所在土壤

面臨挑戰：客戶自備的試劑盒，DNA提取濃度比較低（37.2 ng/μl），260/280為1.796，純度僅為0.044，后續要做擴增子測序和高通量芯片熒光PCR，不能滿足后續實驗要求。

試用體驗： 結合MP公司提供的技術建議，經實驗優化后，DNA提取濃度和純度都有所提升，腸道內容物濃度為87 ng/μL，土壤樣本濃度為48 μg/uL，260/230為1.4。目前提取出的濃度已滿足下游的實驗用量。
 

案例分享3

樣本類型：農田土壤

面臨挑戰：提取DNA效果不理想。

試用結果數據：

試用體驗： 操作便捷，提取的DNA作為模板進行qPCR，在對照組的土壤樣品中加入了等量的真菌孢子，最終qPCR結果中，實驗組和對照組的CT值基本一致，說明產率上差異不大。

案例分享4

樣本類型：河流湖泊沉積物

面臨挑戰：DNA提取效果差

試用結果數據：

試用體驗：提取的DNA純度有明顯提高，260/230遠大于1.0，DNA純度較好，提取操作步驟比較簡便。
 

【微生物樣本】

土壤基因組DNA提取試劑盒（柱膜法）SPINeasy DNA Kit for Soil不僅可用于土壤樣本DNA提取，試劑盒內裂解液、雜質去除劑及漂洗液能夠針對菌體特性很好地去除影響DNA純化以及下游實驗的抑制劑，從而提取到更多的微生物DNA。

案例分享5

樣品類型：水管內壁生物膜，提取管道內的淤泥和滋生的各種微生物

面臨挑戰：DNA提取純度低。

試用結果數據：

試用體驗：試用后A260/230達到了1.73，純度大大提高，對實驗結果滿意。
 

【糞便與腸道菌群】

在過去的十年里，糞便樣本分析實驗占了很大比例。這些被消化的廢物和微生物基質中含有的微生物群落影響著我們多種健康線索。不過嘛，整個實驗操作過程可談不上很愉快。對于糞便樣本DNA提取，獲得純凈、無抑制作用的DNA，同時保持高的產量，操作時間縮短那是最好不過了。以下是使用MP糞便基因組DNA提取試劑盒（柱膜法）SPINeasy DNA Kit for Feces（貨號#116531050），看看他們有什么心得體會吧~

案例分享6

樣本類型：蜜蜂糞便

面臨挑戰：DNA提取純度低，260/230低，260-280之間沒有明顯峰值

試用結果數據：

試用體驗：提取結果較好，滿足宏基因組測序要求。

案例分享7

樣本類型：小鼠糞便和腸道內容物

面臨挑戰：DNA提取效果不理想

試用結果數據：
 

試用體驗：試劑盒整體上使用起來操作比較簡單，提取效果較好，260/230大于1.0，滿足后期PCR和測序需求。