組織化學研究證明汗管囊瘤含典型小汗腺起源的磷酸化酶和水解酶。在真皮上部和中部可見許多囊狀導管和一些實性表皮細胞索，包埋于纖維基質中。囊狀導管壁常襯以兩層細胞，大都扁平。內層細胞偶呈空泡狀。一些導管的外壁細胞向外凸出彎曲，形如逗號或蝌蚪樣。在連續切片中，可見這些囊性導管與表皮內導管的擴張囊相連，但不與下方的大汗腺分泌段相連。
