秋季過敏性皮炎的發病機理有外因和內因之分：
外因：包括飲食、吸入物、氣候、接觸過敏物因素等。其中海鮮、蛋白質，辛辣食品、酒、吸入花粉、塵螨、寒冷天氣、接觸化學物品、肥皂、洗滌劑等是秋季過敏性皮炎最常見的誘因。
內因：過敏物質與支氣管粘膜，鼻粘膜，皮膚血管相結合，產生噴嚏流涕的過敏性鼻炎，喘憋不止的過敏性哮喘，瘙癢皮癥的臉部秋季過敏性皮炎等。在秋季過敏性皮炎反應的發生過程中，過敏介質起著直接的作用，過敏原是秋季過敏性皮炎病癥發生的外因，而機體免疫能力低下，大量自由基對肥大細胞和嗜堿粒細胞的氧化破壞是秋季過敏性皮炎發生的內因。