糞便檢驗的主要目的是了解消化道及肝臟、膽道、胰腺器官的功能，是否有炎癥、出血、潰瘍及寄生蟲感染，分析有無腸道致病菌感染，糞便檢驗對腸道及消化器官疾病的診斷有著重大的意義。
隨著實驗室自動化檢驗設備飛速發展，糞便檢驗的自動化也越來越受到關注。下面就糞便常規檢驗和糞便自動化儀器兩個方面跟大家討論。
一、 糞便常規檢驗
糞便常規檢驗包括理學、顯微鏡和化學檢查三個方面。
1、理學檢驗 糞便顏色變化及外觀性狀可以間接判斷消化系統功能狀態，例如：當上消化道出血時，會出現黑色柏油樣大便；綠色大便發生于乳兒腸炎、甘汞、大量蔬菜、抗生素治療等情況；米湯樣大便多出現痢疾細菌感染；大便顏色可以初步判斷膽道的阻塞情況，外觀形狀是大便常規的重要項目，對疾病的判斷有重要指導作用。糞便的主要成分包括細菌（約占固體成分的1/3）、無機物、膽汁、腸道分泌物、白細胞、上皮細胞、未消化的殘渣、不能消化的或不能被吸收的食物等。
2、顯微鏡檢查 糞便中有形成分：細胞、結晶、脂肪滴及寄生蟲是顯微鏡檢查的重要內容，目前多采用鹽水稀釋涂片法，要求采用“城垛式”閱片方式，在低倍鏡下觀察全片（至少20個視野），再轉用高倍鏡觀察物質的結構等信息（10個以上視野)。
糞便中常見的細胞有紅細胞，白細胞，上皮細胞，巨噬細胞等，這些細胞的形態有別與血液中的形態，鏡下要注意辨認。還有一些成分，例如：真菌、脂肪球、淀粉顆粒、植物纖維、肌纖維、、結晶等等。隨著生活質量和醫療水平的提高，人們感染寄生蟲的感染率在近幾年來一直在下降，糞便中寄生蟲（蟲卵）的檢出率越來越低，常見的寄生蟲（卵）如：肝吸蟲卵、蛔蟲卵、鉤蟲卵、鞭蟲卵、蟯蟲卵、姜片卵、肺吸蟲卵、絳蟲卵等。
對于一些常見寄生蟲和蟲卵的鑒別尤為重要，例如：（1）布氏姜片蟲卵大小為130-140μm×80-85μm、裂頭絳蟲卵大小為55-76×41-56μm、肺吸蟲卵大小為80-118×48-60μm、肝片蟲卵大小為130-150×63-90μm、這四種蟲卵在形態上相似都是橢圓形，要從大小，有無卵蓋等方面綜合分析區別，（2）肝吸蟲卵大小為27～35×12～20μm與靈芝孢子20-28×10～17μm形態相似，大小不同；（3）氣泡與未染色的脂肪滴大小和形態相似，脂肪滴蘇丹染色殷別；（4）糞類圓線蟲大小為0.7-2.0×0.04-0.075 mm與蟯蟲2～13×0.1～0.5mm 外形顏色相似，但蟯蟲較大；（5）糞類毛滴蟲大小為7 ～ 23μm 與阿米巴滋養體大小為20～40μm都是會游動、無色、有偽足的原蟲，阿米巴滋養體相對較大，等等還有其它寄生蟲和蟲卵之間的鑒別。
根據不同蟲卵的不同特性，選擇不同的檢驗方法：（1）直接鹽水涂片法適用于蛔蟲卵、鞭蟲卵；（2）碘液染色檢查法用于阿米巴原蟲、藍氏賈第鞭毛蟲包囊；（3）沉淀法用于比重相對較大的華支睪吸蟲卵、布氏姜片吸蟲卵、血吸蟲卵；（4）浮聚法主要用于比重較低鉤蟲卵和蟯蟲卵。要重視糞便中有形成分的重要性，為了提高檢驗人員的形態識別能力要定期培訓，正確認識糞便中病理成分與正常成分的形態與鑒別要點，參加全國衛生部室間質控，并組織學習分享，嚴格操作，涂片厚薄適宜，從多方面提高糞便鏡檢的質量。
3、化學檢查 潛血試驗目前較常用是檢測糞便中的血紅蛋白和轉鐵蛋白。血紅蛋白可以通過化學法與免疫膠體金法測定，但化學法容易受動物血紅蛋白影響造成假陽性，另外維生素C、鐵劑、綠色蔬菜均會造成假陰性，所以目前比較少用。因此免疫膠體金法測定最為常用，但也要注意引起假陰性原因：（１）血紅蛋白或紅細胞經過消化酶降解變性或消化耗盡已不具有原來免疫原性；（２）過量大出血而致反應體系中抗原過剩出現后帶現象；（3）患者血紅蛋白的抗原與單克隆抗體不配。轉鐵蛋白用免疫膠體金法測定，作為上消化道出血檢測的補充。還有輪狀病毒、腺病毒、諾如病毒、幽門螺桿菌等檢測。
二、 糞便自動化儀器檢測
糞便檢驗傳統手工方法的缺點：可操作性差、工作環境差有異味、容易交叉污染、整批檢驗速度慢、生物安全難管理，并隨儀器科技的發展，糞便自動分析儀器越來越受到臨床的歡迎，市場上也出現了各種品牌的糞便自動化儀器，下面我將和大家分享科瑞杰公司的糞便自動分析儀器（型號：KRJ/FJ3-1T-10DC）的使用的心得和該款儀器的一些優缺點。
1、“模擬人工直接涂片法”是該儀器的亮點，有些儀器將標本過濾，取過濾液鏡檢。過濾對質量造成的最大影響是改變了標本的原始成分，影響了檢出結果。
2、取樣量和人工操作取樣量一致。直接涂片，無管道傳輸，不存在管道堵塞，如標本在管道中傳輸，易發生交叉污染，直接影響到鏡檢結果。
3、閱片面積大，閱片面積不小于18mm*20mm。可大大提高了異常有形成分的檢出率。
4、顯微鏡外置目鏡是保證檢驗質量的重要部分。糞便的有形成分多樣且復雜，涂片靜置后，由于有形成分之間的不同自身特性，在鏡下大概可以觀察到上、中、下幾個層面，設置外置顯微鏡目鏡，檢驗人員可以通過顯微鏡目鏡對結果進行確認。
5、儀器可自動拍攝鏡檢圖像留取圖文報告，如果檢驗員通過圖像發現可疑標本后，可以通過顯微鏡目鏡復查并進行確認。
6、標本前處理同時可作潛血試驗及轉鐵蛋白檢測。
7、但儀器對標本量要求較高，5-10克過多或過少對結果有不同程度影響。8、每架一批10個標本檢測最為節約。
自動化糞便檢驗儀的應用，能為開展糞便檢驗室內質控與室間質評奠定基礎，提高標本的檢測速度，生物安全的規范化，有效減少檢驗者被污染的機會,保存大量形態學圖像資料，方便學習比對,為糞便形態學標準化分析做出重要的積極一步。