注意事項
檢查前準備：
排便前停用止瀉藥、抗酸劑或抗生素，或進行鋇劑X線檢查。若便秘，可服用硫酸鎂或硫酸鈉。
檢查時要求：
(1) 糞便檢驗應取新鮮的標本，盛器在潔凈，不得混有尿液，不可有消毒劑及污水，以免破壞有形成分，使病原菌死亡和污染腐生性原蟲。
(2) 標本采集后應于1小時內檢查完畢，否則可因PH膠消化酶等影響導致有形成分破壞分解。
(3) 查痢疾阿米巴滋養體時應于排便后立即檢查。從膿血和稀軟部分取材，寒冷季節標本傳送及檢查時均需保溫。
(4) 檢查目本血吸蟲卵時應取粘液、膿血部分、孵化毛蚴時至少留取30克糞便，且須盡快處理。
(5) 檢查蟯蟲卵須用透明薄膜拭子于晚12時或清晨排便前自肛門周圍皺裂處拭取并立即鏡檢。
(6) 找寄生蟲蟲體及作蟲卵計數時應采集24小時糞便，前者應從全部糞便中仔細搜查或過篩，然后鑒別其種屬；后者應混勻后檢查。
(7) 做糞膽原定量時，應連續收集3天的糞便，每天將糞便渴勻秤重后取出允20克送檢。
(8) 做細菌學檢查的糞便標本應采集于滅菌有蓋的容器內立即送檢。
(9) 無糞便排出而又必須檢查時，可經肛門指診或采便管拭取標本，灌腸或服油類瀉劑的糞便常因過稀且渴有油滴等而不適于做檢查標本。
(10) 糞便檢驗后應將紙類或塑料標本盒投程度焚化爐中燒毀。搪瓷容器應泡于消毒液中(如過氧乙酸、煤酚皂液或新潔爾滅等)24小時，棄消毒液后，流水沖洗干凈備用。所用載上玻片需用5%煤酚皂液浸泡消毒。
不適宜人群：
本檢查為常規檢查，沒有不適宜人群。
檢查過程
直接涂片檢查法：是最簡便和常用的方法，但是，當人體內寄生蟲數量不多而糞便中蟲卵少時，有時不能查出蟲卵。
本法是在載玻片上滴一些甘油和水的等量混合液，再用牙簽挑取少量糞便加入其中，混勻，夾去較大的或過多的糞渣，最后使玻片上留有一層均勻的糞液，其濃度的要求是將此玻片放于報紙上，能通過糞便液膜模糊地辨認其下的字跡為合適。在糞膜上覆以蓋玻片，置低倍顯微鏡下檢查。檢查時，應順序地查遍蓋玻片下的所有部分。
集卵法：
(1) 沉淀法：取糞便5g，加清水100ml以上，攪勻成糞汁，通過260-250μm(40-60目)銅篩過濾，濾液收集于三角燒瓶或燒杯中，靜置沉淀20-40min，傾去上層液，保留沉渣。再加水混勻，再沉淀，如此反復操作直到上層液體透明后，吸取沉渣檢查。此法適用于檢查吸蟲卵。
(2) 漂浮法：取糞便10g，加飽和食鹽水100ml，混合，通過250μm(60目)銅篩，濾入燒杯中，靜置半小時，則蟲卵上浮；用一直徑5-10mm的鐵圈，與液面平行接觸以沾取表面液膜，抖落于載玻片上檢查。此法適用于線蟲卵的檢查。
也可取糞便1g，加飽和食鹽水10ml，混勻，篩濾，濾液注入試管中，補加飽和鹽水溶液使試管充滿，管口覆以蓋玻片，并使液體和蓋玻片接觸，其間不留氣泡，直立半小時后，取下蓋玻片鏡檢有無蟲卵。
以上漂浮法和沉淀法，均使液體靜置待其自然下沉或上浮。也可將以上糞液置于離心管中，在離心機內離心，借助離心力以加快其沉淀或上浮過程。
常用的漂浮液
飽和食鹽水：在1000ml水中加食鹽380g，比重約1.18。
飽和硫代硫酸鈉溶液：在1000ml水中，加硫代硫酸鈉1750g，比重在1.4左右。
此外還有飽和硫酸鎂溶液，硫酸鋅溶液等。
(3) 錦綸篩兜集卵法：取糞便5-10g，加水攪勻，先通過260μm(40目)的銅絲篩過濾；濾下液再通過58μm(260目)錦綸篩兜過濾，并在錦綸篩兜中繼續加水沖洗，直到洗出液體清澈為止；爾后取兜內糞渣涂片檢查。此法適用于寬度大于60μm的蟲卵。