肺地霉菌病的臨床癥狀、體征無特異性，且正常人的口腔和腸道中，可檢出念珠地絲菌。因此，診斷本病除多次查獲菌體或孢子外，尚須結合其他臨床資料，包括基礎疾病，免疫機制狀況等，并除外肺結核，細菌性、病毒性、支原體性支氣管炎和肺炎，以及其他真菌性疾病后方可確定。皮試陽性可作輔助診斷依據。
