腎結核對側腎積水主要是膀胱炎和血尿的鑒別診斷。
①非特異性膀胱炎常突然發生，反復發作，時輕時重，血尿常與膀胱刺激癥同時發生。而腎結核引起的結核性膀胱炎從尿頻開始，逐漸并持續加劇。血尿都是膀胱刺激癥狀后一段時間出現，但有時也可合并非特異性感染，約占20%～60%。其中最多見的是大腸桿菌感染。
②尿道梗阻性病變引起的膀胱刺激癥狀均在排尿困難癥狀以后發生，多數伴有非特異性感染。膀胱結石的膀胱炎在排尿時可有尿線突然中斷，伴有尿道內劇烈疼痛。膀胱腫瘤的膀胱刺激癥狀都在長期無痛血尿以后出現，此時腫瘤已有浸潤波及鄰近三角區。而腎結核血尿多在長時間尿頻以后，以終末血尿為其特點。
③雙腎結核、孤立腎腎結核或腎結核對側腎積水都有腎結核的癥狀，且都可以有腎功能低下，泌尿系造影時往往影像不清或完全不顯影，因此，盡管其臨床和X線檢查所見很相似，但治療上卻有原則的區別，所以在診斷中應予鑒別。