由于基因表達必然消耗一定的能源和前體物,相對于阻遏和弱化作用,反饋抑制作用更為經濟和高效。終產物Trp對催化分支途徑幾步反應的酶具有反饋抑制作用,其50%抑制濃度分別為:鄰氨基苯甲酸合酶,0. 0015 mmol·L - 1 ;
鄰氨基苯甲酸磷酸核糖轉移酶,0.15 mmol·L-1;色氨酸合成酶,7.7mmol·L-1。對于普通野生菌株,鄰氨基苯甲酸合酶對Trp合成起到關鍵調控作用,常被稱為瓶頸酶;但對高產Trp工程菌而言,上述任何一種酶的反饋抑制都會直接影響Trp產量。
研究發現酶蛋白某些特殊位點突變可以導致對反饋抑制作用敏感性顯著下降,如鄰氨基苯甲酸合酶38位的絲氨酸被精氨酸取代,抗反饋抑制能力顯著提高,當環境中Trp濃度為10 mmol·L-1時酶活性不受影響,而相同條件下野生型酶活性不到1%。
鄰氨基苯甲酸磷酸核糖轉移酶162位纈氨酸被谷氨酸取代,抗反饋抑制能力也有顯著提高,當環境中含有0.83 mmol·L-1色氨酸或0.32 mmol·L-1 5 - 甲基-色氨酸時,酶活性分別為野生菌的3.6倍和2.4倍。