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    發布時間:2018-03-16 14:07 原文鏈接: 蛋白鑒定方法之氨基酸組分分析

      1977年首次作為鑒定蛋白質的一種工具,是一種獨特的“腳印”技術。 利用蛋白質異質性的氨基酸組分特征,成為一種獨立于序列的屬性,不同于肽質量或序列標簽。 Latter首次表明氨基酸組分的數據能用于從2-DE凝膠上鑒定蛋白質。 通過放射標記的氨基酸來測定蛋白質的組分,或者將蛋白質印跡到PVDF膜上,在155℃進行酸性水解1 h,通過這一簡單步驟的氨基酸的提取,每一樣品的氨基酸在40min內自動衍生并由色譜分離,常規分析為100個蛋白質/周。 依據代表兩組分間數目差異的分數,對數據庫中的蛋白質進行排榜,“冠軍”蛋白質具有與未知蛋白質最相近的組分,考慮冠亞軍蛋白質分數之間的差異,僅處于冠軍的蛋白質的可信度大。

      Internet上存在多個程序可用于氨基酸組分分析,如AACompIdent,ASA,FINDER,AAC-PI,PROP-SEARCH等,其中,在PROP-SEARCH中,組分、序列和氨基酸的位置被用來檢索同源蛋白質。 但仍存在一些缺點,如由于不足的酸性水解或者部分降解會產生氨基酸的變異。 故應聯合其他的蛋白質屬性進行鑒定。

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