在分析換能原理時，總是理想地讓細胞一個個地通過寶石微孔。但是紅、白細胞的直徑一般是7－10μm，大者也只有20μm左右，而寶石微孔的孔徑卻為100μm。實際上會存在兩個、三個甚至更多細胞，一同或前后尾隨進入小孔“敏感區”的可能性，雖然這種情況產生的脈沖幅度比單個細胞要高，但它只能產生一個信號脈沖，使計數有所丟失。這種現象稱為重合損失。為了彌補這種損失，電路中設有重合校正電路或用軟件校正。重合損失通常都是按泊桑(Poisson)分布規律加以校正的，校正規律是：計數值在8000以下時不校正。計數值在8000－38000時，每計數1000個含補充的100個數。即在這個范圍內，計數電路每計900個便向千位進1。在38000以上時，每計數1000含補充的200個。即在38000以上，計數器每計數800個向千位進l。經重合校正后，計數結果接近實際值。